1987年，南阳大学成立，设置化工工艺专业；

1988年，增设食品工程专业；

1989年，成立化学工程系、食品工程系，食品工程系增设生化工程专业；分别成立化工、食品工程专业党支部；

1991年，食品工程系更名为生化工程系；

1996年，化学工程系与生化工程系合并成立生物与化学工程系，成立生物与化学工程系党总支；

2005年，生物工程、化学工程与工艺两个本科专业通过河南省新增本科专业验收；

2006年，更名生物与化学工程学院，生物工程、化学工程与工艺两个本科专业通过合格评估；成立生物与化学工程学院党总支；

2008年，和西北农林科技大学合作，率先联合培养硕士研究生；关琳飞等8名同学被省、市团委分别授予“见义勇为优秀大学生”荣誉称号；

2011年，食品科学与工程专业批准为省级特色专业；食品科学与工程、生物工程卓越工程师计划试点专业获得国家相继批准建设；

2016年，食品科学与工程专业被确定为三个重点推荐申报硕士点专业之一；调整为生物与化学工程学院党委；

2017年，生物工程技术、化学工程技术获批省级高等学校实验教学示范中心；河南省工业微生物资源与发酵技术重点实验室获批立项；生物工程合作办学项目顺利通过教育部评估；实施教师党支部书记“双带头人”培育工程；探索开展创建“学习型、服务型、创新型”党支部；校级标兵文明单位；

2018年，1名教师获“河南省五一劳动奖章”，食品工艺、应用化学教研室获批河南省基层合格教研室；荣获“南阳市先进基层党组织”；被评为“合力育人工程”先进单位；

2022年，新增生物与医药硕士学位授权点培育项目；与郑州大学联合培养生物与医药专业硕士研究生，生态酿酒行业学院立项建设为河南省特色行业学院；第一教师党支部荣获全国党建工作样板支部培育创建单位；第二学生党支部荣获河南省样板支部创建单位；学院团委获河南省“五四红旗团委”；

2023年，生物与医药入选为新一轮河南省重点学科；“河南生态酿酒产业学院建设”获批河南省示范校建设重点实施项目立项；学院党委获批河南省标杆学习培育创建单位；第一教师党支部获批全省高校“双带头人”教师党支部书记工作室建设单位；

2024年，成立生物与医药学科研究院，聘任屈凌波教授为学科研究院首席专家；学院党委获批河南省标杆院系培育创建单位；第一教师党支部顺利通过第三批“全国党建工作样板支部”建设单位验收；第一教师党支部顺利成为全国高校“双带头人”教师党支部书记“强国行”专项行动团队；“南水北调水源地保护雷锋连”首次入选中国青年志愿者协会第六次会员代表大会团体会员和河南省青年志愿者协会第新一届会员理事单位；